在二战期间，该教堂曾被“斯巴达克”协会(society "Spartak")改造为体育训练和教学的场地，由此教堂的外观被极大改变，建筑本身也在战争中严重损毁。

    直到1993年，圣母玛利亚教堂才被归还到信徒们手中。教堂的外观、内饰以及它那独一无二的绘画和管风琴也都在之后的十几年间得以陆陆续续的修复及复原。