在巴尔干半岛战争（Balkan Wars）之初，有1379名学生（725名男生和654名女生）入学。第四个学院，即医学院因此建立于1917年。第五个学院，即农学院在1921年建立。1923年，兽医学院和神学院建立。1922-1923年，索菲亚大学（Sofia University）有111名教授，205名讲师和助教，以及2388名学生，其中有1702名男生和686名女生。

索菲亚大学（Sofia University）宏伟建筑的基石铺于1924年6月30日，资金由埃夫洛吉•格奥尔基耶夫（Evlogi Georgiev）和赫里斯托•格奥尔基耶夫（Hristo Georgiev）兄弟担保。教区长根据法国建筑师亨利•布里安松（Henri Bréançon）最初规划设立，因为法国人在1907年Henri Bréançon荣获了为该建筑设计而特意举办的1907年为此目的的竞赛。规划由尼古拉•拉扎洛夫（Nikola Lazarov）开发，由约尔丹•米兰诺夫（Yordan Milanov）修订。约尔丹•米兰诺夫（Yordan Milanov）同时也领导了这次建筑，但他于正式开放日即1934年12月16日之前逝世。

该大学的第一篇博士论文属自然科学领域，由瓦希尔•詹科夫（Vasil Tsankov）撰写，于1929年10月27日问世。第二篇则来自，化学领域的，该论文于1930年7月1日问世，由亚历山大亚里山德尔•斯帕索夫(Aleksandar Spasov)撰写。1930-1931年间，该大学培养了四名博士。

1944年9月9日，随着政治变革，保加利亚共和国诞生。这个国家的大学系统也随之发生巨大改变。1944–45年，13627名学生入学，由182位教授、读者以及286名助教授课。认同共产主义的教授被提拔到大学当局的更高级别，而那些不认同的将被解雇。特殊的与共产党政党相关的教授制度建立起来，该大学需严格按照苏联模式运行。3个新的学院建立于1947年，森林学院、畜牧学院和经济学院，主要的变更也页出现了，许多学院在随后的年份脱离，形成单独的学院。

南极大陆的亚历山大岛上有一座索菲亚大学山，是1988年为了索菲亚大学（Sofia University）位于亚历山大岛（Alexander Island），南极大陆（Antarctica）是根据这所大学命名，以庆祝1988年它的百年纪念日，并感谢大学对南极探险探险（Antarctic exploration）所作的贡献而专门命名的。

学院和部门

索菲亚大学（Sofia University）提供16个学院的范围广泛的学位。

生物学院

化学院

古典与现代语言学院

经济学院和商业管理学院

教育学院

地质学院和地理学院

历史学院

新闻学院和大众传播学院

法学院

数学院与信息学院

哲学院

物理学院

学院前教育和小学院教育学院

斯拉夫语

神学院

医学院