重庆自然博物馆是重庆市文化局主管的市属文化事业单位，也是我国仅有的7所综合性自然科学博物馆之一，代表国家履行自然标本收藏、科学研究和科学普及职责。现为“全国科普教育基地”、“重庆市爱国主义教育基地”。

该馆具有丰厚的博物馆文化积淀，其前身为1930年由卢作孚先生创办的“中国西部科学院”，以及1943年由十余家全国性学术机构联合组建的“中国西部博物馆”。据不完全统计，有近50位著名科学家参与了中国西部博物馆的筹建工作，其中有21位陆续成为新中国的学部委员或院士。

目前重庆自然博物馆新馆建设项目已经启动，选址北碚区缙云山麓的新城缙云大道旁。到2009年6月18日，建筑面积达30000平方米的新馆可望落成并向市民开放。